以京大医学部为目标的高中生上终瓜生。在儿童福利院长大的瓜生，被位于京都的神社“甘神神社”的宫司收养，寄居于此。
在那里，他开始了与夜重、夕奈、朝姬巫女三姐妹的同居生活。寄居的条件是“作为女婿继承神社”。
故事围绕瓜生与三姐妹的相亲，以及甘神神社遇到的难题展开。在同一屋檐下，与巫女们共同生活的恋爱喜剧。
在孤儿院长大的男高中生志愿是京都大学的医学院，他在需要离开孤儿院借住的年纪，被甘神神社宫司收养。寄住的条件是“以女婿的身份接任神社”。不相信神、一心学医的他和神社家三位性格各异的巫女开始了同住一个屋檐下的生活。
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